Enfeksiyonlar. immun baskýlayýcý ajan kullananlarda sýk görülür.
Ciddi kanamalar. Yeni karaciðer henüz pýhtýlaþma faktörlerini yeterince yapamayabilir.
Büyük damarlarda pýhtýlaþma. karaciðeri besleyen portal ven de özelikle ve hepatik venlerde pýhtý ile týkanma olabilir. bu durumda ani karaciðer yetmezliði geliþebilir.
Safra yolu sorunlarý. safra sýzýntýsý veya safra yolu ile ince barsak bileþke yerinde daralma olabilir.
Rejeksiyon. vücud normalde yeni karaciðeri atmak ve yoketmek isteyecektir. vücudun savunma sistemini bunu yapmaktan alýkoymak için immun baskýlayýcý ilaçlar verilir. Ýlaçlara raðmen bir çok hasta rejeksiyon ataklarý geçirebilir. bu durumda ilaçlar artýrýlýr veya baþka ilaçlar denenir.
Kanser. immun baskýlayýcý ilaçlarýn uzun sürede yan etkileri olarak kanserler görülebilir. immun sistem ayný zamanda geliþen kanser hücrelerini de normalde öldürür. bu görevlerini yapamadýðýnda kanser merkezleri oluþabilir. en sýk görülen cilt kanserleri ve lenfomadýr.