MR nefrotoksik kontrast ajan kullanmadan yüksek rezolüsyonlu görüntüler elde etmek için baþarýlýdýr. MR ýn hepatosellüler karsinomada duyarlýlýðý helikal tomografi kadar yüksektir. MR da  hcc T2 aðýrlýklý görüntülerde yüksek yoðunluk paterni gösterir, T1 aðýrlýklý imajlarda ise düþük yoðunluk paterni gösterir. Siroz hastalarýnda rejeneratif nodüllerle hcc nodüllerini ayýrmak gerektiði durumlarda, MR, ultrason ve tomografiye üstündür. Sistematik bir derlemede yapýlan çalýþmada referans standard olarak rezekte edilmiþ karaciðerler alýnmýþ ve bu çalýþmada MR ýn duyarlýlýðý %81 özgünlüðü ise %85 olarak bulunmuþtur. 

Gadolinium gibi bazý MR kontrast ajanlar böbrek yetmezliði olan hastalarda nefrojenik sistemik fibroz / nefrojenik fibroze edici  dermatopatiye yol açabilir. Bu nedenle alternatif kontrast maddeleri kullanýlmalý veya baþka metotlar denenmelidir. 

Yeni bir metot olan MR anjiyografi tek nefes tutmada arteryal, portal venöz ve geç venöz fazlarý çekebilmektedir. Bu teknikle ilgili yapýlan bir çalýþmada 10 mm ve üzeri hcc nodüllere %76ya karþý %61 oranýnda daha duyarlý bir þekilde tespit edilmiþtir.

Öte yandan MR ýn yüksek maliyet nedeniyle birçok radyolog tarafýndan helikal tomografi halen favoridir. MR anjiyonun yeri hala araþtýrma safhasýndadýr. MR kontrast maddeye allerjisi olan  ve böbrek yetersizliði olan kiþilerde faydalý olabilir. Öte yandan tomografi sonuçlarý anlaþýlmaz olan yol gösterici olmayan vakalarda yine MR faydalý olabilir. MR aþýrý derecede nodüller olan karaciðerlerde displastik nodülleri hcc den ayýrabildiði için faydalý olacaktýr. Ayný þekilde MR karaciðerdeki hemanjiyom gibi vasküler lezyonlarý ayýrmada ve lokal yaðlanmayý hepatosellüler karsinomdan ayýrmada tomografiye üstündür.