Ýki günden fazla ve günde üç kereden fazla ishale çýkan kiþilerde clostridium difficile toksini dýþkýda deðerlendirilebilir. Veya beraberinde ateþ ve geceyi ishalleri de oluþuyor ise sayý günde 10 15i buluyorsa dýþkýlama sayýsýný bir gün bile sürse clostridium difficile testleri yapýlabilir.

Labaratuvarda kullanýlabilecek metotlar arasýnda sitotoksisite ölçümü toksin Ave B nin enzim immünoassay metoduyla bakýlmasý, glutamat dehidrogenaz enzimin ölçülmesi ve PCR sayýlabilir. Sitotoksin assay metodu 48 saatlik zaman alýr, altýn standart olarak kullanýlýr. Toksin B nin fibroblast hücre kültüründe fibroblastlarý etkilemesi ve yuvarlaklaþtýrmasýyla taný konur. Gerektiðinde spesifisiteyi ve özgüllüðü artýrmak için toksin önceden nötralize edici antikorlarla muamele edilerek teste katýlabilir bu da özgürlüðü artýrýr.

Enzim immün assay metodu ile toksin A ve B ve bazý ticari ürünlerde sadece sadece A ölçülebilmektedir. Duyarlýlýk %65- 95 arasýnda deðiþir. Özgüllük ise %99 civarýndadýr. Ancak duyarlýlýk düþüktür, bunun sebebi de enzim immün assay metodu ile toksin A veya B yi tespit edebilmek için 100- 1000 pgr toksine ihtiyaç vardýr. Oysa ki sitotoksin assay metodunda 10 pgr  toksin B hücrelerde yuvarlaklaþmayý saðlayabilmektedir. Enzim immün assay metodu ile testin sonuçlanmasý 24 saati bulmaktadýr.  

Ticari olarak polimer zincir reaksiyonu için 2009 yýlýnda 3 ürün FDA onayý almýþtýr ancak ekonomik olmamasý nedeniyle heryerde kullanamamaktadýr .

Organizmanýn tespiti için common antijen testi kullanýlabilir bu glutamat dehidrogenaz antijenini    tespit eder. Pozitif olanlar dýþkýlar ise daha sonra sitotoksin assay testine tabi tutulurlar. 

Dýþký kültür testi ise anaerobik bir ortam gerektiðinden dolayý her yerde yapýlmaz. Zamanýn sýnýrlamasý ve gerçekleþtirme için uðraþtýrýyor olmasý, rutin kullanýmýna engeldir .

Endoskopi: dýþký toksin ölçümü pozitif olan bir hastada endoskopi klasik bulgularla gerekli deðildir.