Siprofloksasin oftalmik solüsyona iyi tolere edilir. Bildirilen yan etkilerin çoğu hafif olup özel bir tedaviye lüzum kalmadan kendiliğinden iyileşir. Çeşitli göz hastalıkları nedeniyle siprofloksasin göz damlası kullanan hastaların yaklaşık % 10’unda damladan sonra lokal göz şikayetleri (yanma, batma) görülür.

Bakteriyel keratitis tedavisi sırasında hastaların % 17’sinde kornea ülserinin çevresinde beyaz granüler veya billuri yüzeysel bir çökelti oluşur. Bu çökelti siprofloksasin maddesidir ve tedavinin etken devresinde (1-7 gün) ilacın sık aralarla yoğun bir biçimde tatbikinden kaynaklanır. Tedavinin daha sonraki devrelerinde doz ve uygulama sıklığı azaldığında çökelti de kendiliğinden kaybolur. Bu presipitasyonun varlığı siprofloksasin tedavisinin devamına bir engel teşkil etmediği gibi kornea ülserinin klinik seyrini ve vizyonun akıbetini de etkilemez ve özel bir tedaviyi gerektirmez. Bakteriyel keratitli hastalarda yapılan bir araştırmada bu yüzeysel presipitasyon halkasının gençlere göre yaşlılarda (60 yaşın üstünde) daha sık görüldüğü saptanmıştır. Ancak çökelti olasılığı hastanın cinsiyeti, ülserin veya infiltrasyonun derinliği, kültürde üreyen mikroorganizma ve enfeksiyonun iyileşme süresiyle ilgisi yoktur.

Siprofloksasin oftalmik solüsyon ile görülen diğer yan etkilerin sıklığı yaklaşık % 10 olup bunlar : gözkapağı kenarında kabuklanma, kirpiklerde kristal ve pul birikmesi, yabancı cisim hissi, kaşıntı ve konjunktival hiperemidir. Hastaların % 1’inden azında bildirilen yan etkiler : korneada renk değişmesi, keratepati, keratit, allerji, göz kapağı ödemi, lakrimasyon, fotofobi, vizyonda azalması, ve korneada infiltrasyondur.

Çeşitli göz hastalıkları nedeniyle siprofloksasin oftalmik solüsyonu ile tedavi gören

hastaların % 5’inden azında tat duygusunda değişmeler (ağızda fena bir tat hissi) görülür.

Bulantı ise % 1’den az hastada bildirilmiştir.