Bazı çalışmalarda antikor testlerinin ülseratif kolit ve Crohn Hastalığını ayırmada faydalı olabileceği söylenmiştir. Aynı zamanda hastalığın şiddeti ve prognoz hakkında da bilgi verdiği iddia edilmiştir. Ancak bu vergilerin kesinleşmesi için daha fazla çalışmaya ihtiyaç vardır.

pANCA (Antineutrophil sitoplazmik antikorlar) ve ASCA (anti-Saccharomyces cerevisiae antikorları)

Bu antikorların Crohn Hastalığı hastalığı ve ülseratif koliti birbirinden ayırmak için yapılan çalışmalarda hassasiyet tek başına veya birlikte kullanıldıklarında %40 ile 60 arasında özgüllük ise %90ın üzerindedir. İntermediet kolit durumunda bu testlerin ayrıcı özelliği maalesef  %30 larda kalmaktadır.

Öte yandan bir çalışmada çölyak hastalarının %50sinde ASCA pozitifliği bildirilmiştir ayrıca kistik fibroz ve intestinal tüberkülozlarda ASCA pozitifliği bildirilmiştir

OmpC, E. coli dış zarının bir proteinidir. Bu protein pANCA monoklonal antikorlarla karşı immunoreaktiftir. Bir çalışmada Crohn Hastalığı vakalarının %46sında pozitif bulunmuştur.

Diğer antikorlarla da Crohn hastalığında ve diğer inflamatuar barsak hastalıklarında çalışmalar yapılmaktadır. Ancak yeterince güçlü bir antikor henüz mevcut değildir. 

CRP Crohn  hastalığında ülseratif  kolite göre daha yüksek bulunur. Crohn Hastalığı hastalığında CRP hastalık aktivitesi ile paralel olduğu söylenebilir. Ayrıca her ne kadar bunu desteklemeyen yayınlar mevcut olsa da CRP yüksekliği Crohn Hastalığı hastalığında relaps gelişme ihtimali olduğunu işaret eder.

Her ne kadar sık kullanılma da inflamatuar barsak hastalıklarında bu test %93 oranda duyarlı ve %96 oranında özgül olduğu gösterilmiştir.

Giderek artan oranda inflamatuar barsak hastalıklarında tarama testi ve hastalığın aktivitesini ölçmede kullanılmaktadır. Fekal calprotectin konsantrasyonları üst gastrointestinal traktustaki nötrofil infiltrasyonu ile paraleldir. İnflamatuar barsak hastalıkları (İBH) olan hastalarda yüksek duyarlılık ve özgüllük oranlarıyla intestinal inflamasyonu gösterecek ve yerine kullanabilecek bir testtir.

Fekal calprotectin konsantrasyonu irritabl barsak sendromu düşünülen bir hastada <  40 mikrogram / gün seviyesinin altında ise bu hastanın İBH olma şansını %1in altına düşmektedir. Test bu haliyle uygun vakalarda  tarama amaçlı kolonoskopi ihtiyacını azaltabilir.

Tanı almış bir Crohn  hastasında, fekal calprotectin endoskopik aktiviteyle paralellik gösterir. Aynı zamanda hastalığın aktivitesini izlemede, tedaviye alınan cevabı ölçmede, klinik olarak relaks gelişip gelişmediğini tahmin etmede, postoperatif dönemde relapsı ölçmede iyi bir biyomarker olarak kabul edilir.

Postoperatif dönemde > yüz mikrogram / gün düzeyindeki fekal calprotectin seviyeleri endoskopik rekürensi tahminde yüksek hassasiyet oranlarına sahiptir.