Sık görülen yan etkiler yumuşak gaita, artan barsak hareketleri, gaz oluşumu ve diare gibi gastrointestinal bozukluklardır ve büyük sıvı miktarı ile magnevist enteralde bulunan mannitole bağlıdır. Umumiyetle hafif olan bu tür yan etkiler, hastanın genel durumunu ancak çok az oranda etkilerler ve kontras maddenin atılması ile tamamen geçerler. Nadiren bulantı ve kusma oluşabilir. Deri ya da mukoza reaksiyonları gibi aşırı duyarlılık reaksiyonları enderdir.