Seyrek olarak yan etkiler görülür, geçici abdominal kramplar bildirilmiştir. Ekstrapiramidal etkiler küçük çocuklarda nadir, erişkinlerde çok enderdir: tedavinin kesilmesinden sonra kendiliğinden ve tamamen normale döner. Hipofiz bezi kan-beyin engelinin dışında yer aldığından, Motilium prolaktin seviyelerinde artışa neden olabilir. Nadiren bu hiperprolaktinemi, galaktore ve jinekomastiye neden olabilir. Kan-beyin engeli olgunlaşmadığında (bebeklerde) ya da hasara uğradığında, nörolojik yan etkiler tamamen göz ardı edilemez. Nadiren döküntü, ürtiker gibi alerjik reaksiyonlar da bildirilmiştir.