Uygulanacak dozlar bireysel gereksinimlere göre ayarlanmalıdır. 

Uygulamaya oral yoldan, gerekirse intranazal gastrik tüp yolu ile, başlanır. Günlük dozun ikiye bölünerek uygulanması önerilir. Kapsüller tercihen su ile yutulmalıdır. Emilimin maksimum olabilmesi için, kapsüller aç karna (yemekten en az bir saat önce veya yemekten 2-3 saat sonra) alınmalıdır. Kapsüller ilaç alınacağı zaman blister ambalajından çıkarılmalı, çıkarıldıktan sonra 12 saat içerisinde kullanılmalıdır.

Klinik çalışmalara göre, hastaların çoğunluğu 20 ng/mL’nin altındaki takrolimus kan konsantrasyonları ile tedavi edilebilmektedir. Klinik uygulamada, transplantasyon sonrası erken dönemde 12 saatlik kan düzeyleri genellikle 5-20 ng/mL arasındadır.

Normal olarak, graft atılımını baskılamak için kapsüller sürekli olarak kullanılmalıdır. Tedavi için bir süre belirlenemez.

Oral takrolimus tedavisi başlangıç dozu, karaciğer transplantasyonlarında günde 

kg başına 0.10-0.20 mg ve böbrek transplantasyonlarında günde kg başına 

0.15-0.30 mg’dır. Karaciğer transplantasyonu uygulandıktan sonra altı saat ve böbrek transplantasyonu uygulandıktan sonra 24 saat sonra uygulama derhal başlatılmalıdır.

Hastanın klinik durumu oral uygulamaya uygun değil ise, sürekli 24 saatlik infüzyon şeklinde intravenöz takrolimus tedavisine başlanmalıdır. 

Genellikle, pediyatrik hastalarda erişkinlerle aynı kan düzeylerini elde edebilmek için 1-2 katı dozların uygulanması gerekir. Karaciğer ve böbrek transplantasyonunda başlangıç dozu, günde ikiye bölünmüş olarak kg başına 0.3 mg’dır.. 

Normalde Prograf diğer immünsupresif tedavilerle birlikte uygulanabilir. Prograf, siklosporin ile birlikte uygulanmamalıdır. Pratikte, siklosporin tedavisinin sonlandırılmasından 12-24 saat sonra Prograf tedavisine başlanır. Siklosporinin klirensi etkilenmiş olabileceği için siklosporin konsantrasyonunun izlenmesi sürdürülmelidir.

Nefrotoksisite olasılığı nedeniyle, karaciğer ya da böbrek yetmezliği olan hastalarda önerilen intravenöz ve oral doz sınırları arasında düşük dozlar kullanılmalıdır. Ameliyat sonrası oligüri görülen hastalarda Prograf tedavisine başlamak için 48 saat ya da daha uzun bir süre beklenebilir.

Prograf diyaliz ile kandan temizlenmez.